En la provincia de misiones la flora y la fauna se desarrollan en dos ecosistemas típicos: la selva, de características complejas por la diversidad de ecosistemas menores que la componen y se expresan en distintos niveles o estratos, localizada en el centro y hasta el norte, presenta densa y variada vegetación hidrófila como gran diversidad de fauna; y el parque mesopotámico, que es un ecosistema de campo, con vegetación baja de pastos duros y semiduros, con grupos de arboles de menos fuste y presencia de bosques galería a lo largo de los cursos de agua, ocupa el sur de la provincia, con un límite bastante nítido demarcado por las localidades de Santa Ana, Cerro Azul y San Javier.
La selva en distintos grados de conservación ocupa hoy un 35% del territorio de la provincia y en su disminución incidieron distintos factores, como la necesidad de demostrar para fundar pueblos y ciudades o para disponer tierras para la agricultura y la forestación.
Este ecosistema es el más rico y variado en especies - a tal punto que se logró regristrar más de 150 vegetales en una sola hectárea - , y muchas de ellas son exclusivas de la selva misionera. Precisamente por ello es el recurso natural más valioso con que cuenta la provincia, sobre todo por el alto valor que la naturaleza tiene mundialmente y que llevó al gobierno provincial a implementar una sabia política de preservación mediante la creación de Areas Naturales Protegidas.
Entre la verdadera masa inextricable de vegetación que es la selva misionera, se puede distinguir 6 estratos conforme la altura de las especies: estrato de los emergentes a gigantes, formado por arboles que alcanzan los 30-40 metros de altura; estrato de los arboles grandes, formado por individuos que sobrepasan los 10 metros; estrato de los arboles medianos, integrados por los más jóvenes, que todavía no alcanzan la plenitud de su desarrollo; estrato arbustivo, compuesto por una gran diversidad de arbustos, helechos arborescentes, enredaderas, etc, y estrato herbáceo, distribuido a ras del suelo.
Todos los elementos de este ecosistema cumplen una función definida: ser el sustento de mamíferos, insectos y aves que, a su vez, son polinizadores y, además, alimentan a toda clase de herbívoros y éstos, en su momento, a carnívoros y predadores.
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